2016年7月22日，上海市委、市政府召开“崇明撤县设区”工作大会，改崇明县为崇明区。
截至2018年，崇明区有东平国家森林公园、西沙·明珠湖景区、前卫生态村、三民文化村等四个国家4A级旅游景区。2017年，举办森林旅游节、自行车嘉年华、明珠湖鱼鲜节、“二月二龙抬头”文化旅游节、端午季节庆活动等，成为全国健康促进县（区），入选国家级旅游业改革创新先行区创建名录。
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主要景点有:
崇明学宫
崇明学宫位于城桥镇鳌山路696号，为明、清时期的古建筑群，始建于明天启二年（1622），现占地23.21亩，是目前上海地区面积最大的一座孔庙，1984年5月4日被列为上海市文物保护单位。近年来，先后历经三次修复，第一期工程于1997年完成大成殿、东西两庑及500米长古围墙的修复；第二期修复工程于2000年完成东西牌坊、棂星门、泮池、登云桥、东西官厅、戟门、尊经阁、崇圣祠的修缮；第三期修复工程于2002年完成明伦堂、仪门、碑廊的修复。前后共投资1700余万元。崇明学宫作为县博物馆所在地，现有固定展厅7间，展出“崇明岛史与古船”、“崇明民俗”两个基本陈列和“黄丕谟版画陈列室”，另有临时展厅1间。
唐一岑墓
唐一岑墓位于城桥镇苗圃东首，1992年6月被列为上海市文物保护单位。唐一岑（？—1554）于明嘉靖三十二年（1553）任崇明知县，为抵御倭寇侵犯，壮烈牺牲。唐一岑墓现占地2亩，坐东向西，是崇明青少年爱国主义教育基地。
东平国家森林公园
东平国家森林公园位于崇明岛中北部，总面积5400亩。华东地区最大的平原人工森林，国家AAAA级旅游景区，全国农业旅游示范点。园内森林繁茂、湖水澄碧、百鸟鸣唱、野趣浓郁，以“幽、静、秀、野”为特色，集森林观光、会议、旅游、休闲度假、参与性娱乐等多功能为一体。
东滩鸟类国家级自然保护区
东滩鸟类国家级自然保护区位于崇明岛最东端，总面积326平方公里，属长江口典型的河口湿地，列入国际重要湿地名录。保护区拥有丰富的底栖动物和植被资源，是候鸟迁徙途中的集散地，也是水禽的越冬地。崇明东滩记录的鸟类达312种，迁徙水鸟上百万只。
西沙湿地
西沙湿地位于崇明岛西部，总面积为4500亩，是上海唯一具有自然潮汐现象和成片滩涂林地的自然湿地。通过生态引鸟、植物多样性配置、水处理净化等工程，在原有湿地的基础上，修复建成一个集科普教育、科学研究、休闲观光等为一体的多功能湿地生态示范区。
明珠湖
明珠湖公园位于我国第三大岛崇明岛西南部，是目前岛上最大的天然淡水湖，它占地面积6500亩，水域面积3000亩，水容量多达500万立方米，是国家级生态旅游示范基地，，国家3A级旅游景区，也是崇明岛西部水上游乐度假区和西部生态农业观光旅游的主要区域。
前卫生态村
前卫生态村位于崇明岛中北部，全村总面积2.5平方公里，它于1969年从一片滩涂中围垦诞生，经40多年的艰苦奋斗，发展成既有现代化村镇风貌、又有田园诗意、人与自然和谐统一、经济比较发达的生态村，是国家AAAA级景区。
瀛东村
瀛东村是崇明岛第一个迎来日出的村庄，村内绿荫环绕，鱼塘鳞次栉比，自然环境优美，民风纯朴，是理想的旅游休憩胜地。现有村史展示馆、渔具博物馆、崇明岛精神雕像等景点及斗鸡、斗羊、浑水摸鱼、泛舟垂钓等活动项目。
横沙岛
横沙岛位于上海长江口的最东端，是三座岛屿中最娇小的一座，功能定位是“休闲度假岛”，主要开发国际会务会展中心、国际娱乐中心、低密度高档住宅别墅区、游艇俱乐部等项目。1992年横沙岛被国务院列为首批13个国家级旅游度假村之一。
西沙·明珠湖景区
西沙·明珠湖景区占地11900亩，自然风光秀美，环境保护优质，大气指标国家一级，水质标准国家Ⅱ类，非常适宜各类赛事的举办和体育旅游休闲活动的开展。2018年10月31日，西沙·明珠湖景区获评崇明区首家“上海市五星体育旅游休闲基地”称号。
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